Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Krt17Q9QWL7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Krt17Q9QWL7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms