Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcea2Q9QVN7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcea2Q9QVN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms