Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cln8Q9QUK3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms