Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Hdgfl3Q9JMG7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms