Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sfmbt1Q9JMD1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfmbt1Q9JMD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms