Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SrfQ9JM73 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms