Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Reep6Q9JM62 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Reep6Q9JM62 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms