Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cul3Q9JLV5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms