Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cd2apQ9JLQ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cd2apQ9JLQ0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms