Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh9a1Q9JLJ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Aldh9a1Q9JLJ2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms