Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp4Q9JKV5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scamp4Q9JKV5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms