Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ldb3Q9JKS4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms