Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
AtrQ9JKK8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
AtrQ9JKK8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms