Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trem1Q9JKE2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem1Q9JKE2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms