Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ube2j1Q9JJZ4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ube2j1Q9JJZ4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms