Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ddx20Q9JJY4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddx20Q9JJY4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddx20Q9JJY4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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