Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd3Q9JJY3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smpd3Q9JJY3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms