Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sh3bgrlQ9JJU8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms