Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ctnnbip1Q9JJN6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms