Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smad9Q9JIW5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smad9Q9JIW5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms