Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ercc6l2Q9JIM3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms