Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG8

Praf2, PRA1 family protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Praf2Q9JIG8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Praf2Q9JIG8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Praf2Q9JIG8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms