Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl1Q9JI74 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl1Q9JI74 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms