Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LratQ9JI60 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LratQ9JI60 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms