Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc9a3r2Q9JHL1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms