Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RabggtaQ9JHK4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RabggtaQ9JHK4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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