Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcirg1Q9JHF5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tcirg1Q9JHF5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms