Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn12Q9ET43 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms