Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim2Q9ESN6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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