Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Rb1cc1Q9ESK9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Rb1cc1Q9ESK9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Rb1cc1Q9ESK9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms