Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem27Q9ESG4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem27Q9ESG4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms