Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Usp29Q9ES63 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp29Q9ES63 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp29Q9ES63 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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Usp29Q9ES63 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Usp29Q9ES63 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Usp29Q9ES63 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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Usp29Q9ES63 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp29Q9ES63 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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