Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Slc28a3Q9ERH8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Slc28a3Q9ERH8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc28a3Q9ERH8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Slc28a3Q9ERH8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc28a3Q9ERH8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Slc28a3Q9ERH8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Slc28a3Q9ERH8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc28a3Q9ERH8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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