Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hipk3Q9ERH7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hipk3Q9ERH7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms