Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlnrd1Q9ERE8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tlnrd1Q9ERE8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms