Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RhojQ9ER71 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RhojQ9ER71 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms