Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capn12Q9ER56 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn12Q9ER56 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms