Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ndst3Q9EQH7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ndst3Q9EQH7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms