Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cxcr6Q9EQ16 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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