Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpgrip1Q9EPQ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms