Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clstn1Q9EPL2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clstn1Q9EPL2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms