Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms