Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rarres2Q9DD06 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms