Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cpne8Q9DC53 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cpne8Q9DC53 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms