Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrpraQ9DBG7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrpraQ9DBG7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms