Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Erv3Q9DAX3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Erv3Q9DAX3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms