Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ift43Q9DA69 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms