Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9DA42 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9DA42 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9DA42 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9DA42 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9DA42 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9DA42 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9DA42 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9DA42 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9DA42 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms