Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Efhc1Q9D9T8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efhc1Q9D9T8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms