Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdzd9Q9D9M4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms